Hoewel de Jemaison HEPA filter veel goede punten heeft, zijn er ook duidelijke beperkingen. Het meest in het oog springende is het ontbreken van een actieve koollaag voor geuren en gasvormige verontreinigingen (VOCs). Dat betekent dat hoewel de filter uitstekend is in het verwijderen van deeltjes, hij minder effectief is tegen kookluchtjes, sigarettenrook (de geurende component) en chemische dampen. Gebruikers die last hebben van geuren of wonen in gebieden met veel luchtvervuiling waarbij gassen meespelen, missen daardoor een stukje functionaliteit.
Een ander punt is dat er geen expliciete verwijzingen naar onafhankelijke certificeringen of testdata in de productinformatie aanwezig zijn. Waar OEM-filters soms met testresultaten of keurmerken komen, moet je bij deze aftermarket-optie vertrouwen op de opgegeven specificaties zonder openbare testrapporten. Voor professionele toepassingen of voor gebruikers die verifiëerbare, gecertificeerde filtering nodig hebben, is dat een nadeel.
Ten slotte kan het gebruik van een aftermarket filter invloed hebben op garantievoorwaarden van de luchtreiniger bij sommige leveranciers — al zal dit per situatie verschillen. En hoewel de pasvorm doorgaans goed is, kunnen er incidenteel verschillen voorkomen tussen batches, waardoor het verstandig is filters te controleren bij ontvangst. Kortom: prima voor de meeste huishoudens, maar met kanttekeningen voor wie extra zekerheid of uitgebreidere gas- en geurverwijdering zoekt.